8世紀末9世紀初，南亞次大陸的印度教經過商羯羅的改革后，出現了復興運動，這也推動了尼泊爾印度教的發展。據尼泊爾史料記載，商羯羅在晚年曾訪問過尼泊爾，他用壓迫佛教的手段大力推行印度教。佛教雖然受到沉重的打擊，但在尼泊爾谷地和東北山區仍在流傳。嗣后幾個世紀，由于佛數和印度教的融合，出現了混合的密教或“新佛教”。印度密教中的主要派別——真言乘、金剛乘、易行乘和時輪乘幾乎在尼泊爾都得到了廣泛的傳播。尼泊爾是印度易行乘悉地師(成就師)崇拜流行最早的地區之一，這個派別宣傳即身成佛的大乘思想，贊頌《多訶俱舍》在尼泊爾佛教徒中成為日常的行事之一。印度教和佛教密宗的思想和實踐相互吸收、相互滲透，它們的界線很難劃清；在印度教中神殿中常常可以見到佛教的菩薩、佛像，在佛教的寺廟中也可見到印度教的神祗。兩種宗教徒常常崇拜共同的對象，舉行共同的祭祀儀式，并有共同的節日。這種混同的形式自中世紀直至現代一直頗為流行。同時，在佛教中也出現了象印度教一樣的種姓制度。在佛教的僧伽中分為朱古巴(僧侶)、班達耶(佛教僧侶的后裔)、瓦吉拉恰利。耶(高級僧侶、密教師)和烏陀莎(商人、金銀匠、畫匠等出身的僧侶)。在一般佛教徒中也分成若干種姓和亞種姓，從事各種不同的職業。 | 
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